1. Podľa hrúbky kolóny ju možno rozdeliť na dva typy: všeobecná náplňová kolóna a kapilárna kolóna.
Náplňová chromatografická kolóna: Na vytvorenie špirálových kolón sa zvyčajne používajú rúrky z nehrdzavejúcej ocele s vnútorným priemerom 4-6 mm s bežne používanou dĺžkou kolóny 2-4 metrov. Naplňte kvapalnú stacionárnu fázu (plynová kvapalinová chromatografia) alebo pevnú stacionárnu fázu (plynová tuhá chromatografia).
Kapilárna chromatografická kolóna: Rúrka kolóny je kapilára, bežne používaná ako sklenená alebo elastická kremenná kapilára s vnútorným priemerom 0.1-0,5 mm a dĺžka kolóny sa pohybuje v desiatkach metrov na stovky metrov.
Kapilárne chromatografické kolóny možno rozdeliť na otvorené kapilárne kolóny a plnené kapilárne kolóny podľa spôsobu ich plnenia.
2. Podľa separačného mechanizmu sa dá rozdeliť na distribučné kolóny a adsorpčné kolóny, pričom hlavný rozdiel je v pevnej fáze.
Distribučná kolóna: vo všeobecnosti je stacionárna kvapalina (kvapalina s vysokou teplotou varu) nanesená na nosič, aby sa vytvorila kvapalná stacionárna fáza, a separácia sa realizuje rozdielom rozdeľovacieho koeficientu zložiek. Funkčné skupiny stacionárneho roztoku sú spojené na povrchu nosiča prostredníctvom chemickej väzby, ktorá sa nazýva chemická väzbová fáza. Má výhodu bez straty.
Adsorpčná kolóna: Zložená nanesením adsorbentu do chromatografickej kolóny, separácia sa dosiahne využitím rozdielov v adsorpčných koeficientoch zložiek. Okrem adsorbentov pevné stacionárne fázy tiež zahŕňajú molekulové sitá a polymérne porézne mikroguľôčky.